Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sde2Q8K1J5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sde2Q8K1J5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms