Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FgbQ8K0E8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FgbQ8K0E8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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