Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF4

Btd, Biotinidase, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtdQ8CIF4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BtdQ8CIF4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BtdQ8CIF4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms