Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upp2Q8CGR7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Upp2Q8CGR7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms