Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE47

Slc49a3, Solute carrier family 49 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc49a3Q8CE47 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc49a3Q8CE47 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc49a3Q8CE47 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms