Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc17Q8CE13 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc17Q8CE13 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms