Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rsph6aQ8CDR2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rsph6aQ8CDR2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms