Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Slfn5Q8CBA2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Slfn5Q8CBA2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms