Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdh12Q8BYK4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms