Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rbbp5Q8BX09 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms