Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TtpaQ8BWP5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TtpaQ8BWP5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms