Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Catsper4Q8BVN3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms