Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cxcl16Q8BSU2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Cxcl16Q8BSU2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Cxcl16Q8BSU2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cxcl16Q8BSU2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cxcl16Q8BSU2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cxcl16Q8BSU2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cxcl16Q8BSU2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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