Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gga3Q8BMI3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gga3Q8BMI3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms