Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik4Q8BMF5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grik4Q8BMF5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grik4Q8BMF5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms