Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem260Q8BMD6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms