Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Fndc9Q8BJN4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fndc9Q8BJN4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms