Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rspo4Q8BJ73 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms