Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Clrn3Q8BHH8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Clrn3Q8BHH8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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