Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trmt12Q8BG71 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trmt12Q8BG71 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms