Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cpped1Q8BFS6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cpped1Q8BFS6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms