Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg4cQ811C2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Atg4cQ811C2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Atg4cQ811C2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg4cQ811C2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms