Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cracr2bQ80ZJ8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms