Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Kdm5bQ80Y84 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Kdm5bQ80Y84 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms