Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nrde2Q80XC6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nrde2Q80XC6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms