Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
NischQ80TM9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
NischQ80TM9 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NischQ80TM9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms