Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSD4

Tbata, Protein TBATA, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbataQ7TSD4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TbataQ7TSD4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TbataQ7TSD4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms