Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms