Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TwistnbQ78WZ7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TwistnbQ78WZ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms