Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smpd4Q6ZPR5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smpd4Q6ZPR5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms