Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ssxb3Q6XAS4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ssxb3Q6XAS4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms