Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcl3Q6W5C0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms