Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bnip1Q6QD59 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bnip1Q6QD59 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms