Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med16Q6PGF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms