Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HjurpQ6PG16 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HjurpQ6PG16 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms