Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim45Q6PFY8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trim45Q6PFY8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms