Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gramd2bQ6PEM6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gramd2bQ6PEM6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms