Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trak1Q6PD31 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trak1Q6PD31 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms