Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RgmaQ6PCX7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RgmaQ6PCX7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms