Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 1,197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fhod1Q6P9Q4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fhod1Q6P9Q4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms