Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nwd2Q6P5U7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nwd2Q6P5U7 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms