Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdac10Q6P3E7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms