Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slx4Q6P1D7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms