Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rprd2Q6NXI6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rprd2Q6NXI6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms