Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gpbp1Q6NXH3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms