Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpsf6Q6NVF9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cpsf6Q6NVF9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms