Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Frem2Q6NVD0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms