Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SphkapQ6NSW3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SphkapQ6NSW3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms