Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp140Q6NSQ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms