Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CltbQ6IRU5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms